|
Bakterier, celledyrkning, kloning, plasmider, transformation, gelelektroforese,
digestion, massespektrometri, proteiner, nucleotiddatabaser, genomdatabaser,
2D-geler, pathogene mikroorganismer, bioinformatik, En verden af
bioteknologiske værktøjer og muligheder. Det er en del af historien
bag ACE BioSciences A/S.
ACE BioSciences A/S er en bioteknologisk virksomhed, som fokuserer
på forskning indenfor Functional Proteomics. ACE BioSciences A/S
producerer elektroniske 3D-billeder af, hvilke proteiner, som kommunikerer
med hinanden, i en bestemt organisme.
Forskningsområde
ACE BioSciences A/S kortlægger sammenhængen i kommunikation mellem
forskellige proteiner i forskellige sygdomsfremkaldende bakterier
ved at sammenligne proteomer i normale med proteomer i sygdomsfremkaldende
bakterier. ACE BioSciences laver elektroniske databaser over de
sammenhænge, vi finder, i såkaldte proteinkommunikations-netværker
eller Protein Interaction Networks (PIN-databaser). Resultaterne
fra laboratoriet bliver organiseret i avancerede computerprogrammer,
som producerer unikke grafiske billeder for de enkelte organismer,
over hvilke proteiner der kommunikerer med hinanden på et givent
fysiologisk stadium. Dette billede vil se forskelligt ud afhængigt
af, om bakterien er pathogen eller ej. Når vi kombinerer resultaterne
fra laboratoriet med bioinformatiske værktøjer, kan vi simulere
bakteriel udvikling og vækst in silico. Konstruktionen af
en bakteriel eller pathogen simulator kan vise sig at blive nøglen
til forståelse af visse infektionssygdomme.
Formålet med vores forskning er blandt andet at få indblik i, hvilke
proteiner, som har indflydelse på, hvordan en organisme opbygger
cellevæg. Hvis vi kan gå ind og fjerne eller angribe et protein,
som har essentiel betydning for en organismes overlevelse, har vi
mulighed for at udvikle vacciner eller antibiotika mod bakterien.
Et mål i denne proces er at udvikle antibiotika, som rammer mere
præcist, end dem, man kender i dag. Det vil betyde, at man kan bekæmpe
infektioner mere specifikt og med færre bivirkninger.
Mange bakterier og vira gør skade ved at invadere en værtscelle.
Studiet af værts-pathogen interaktioner er også af stor betydning,
når man søger antimikrobielle targets og laver medicin mod dem.
Som et supplerende forskningsområde vil vi konstruere PIN-databaser
over interaktioner mellem den pathogene mikroorganismes proteiner
og værtscellens.
Laboratorier
Grundtanken i ACE BioSciences laboratorier er, at indretningen
giver et naturligt flow i analyser og i arbejdets udførelse. Den
ene ende af laboratoriet er bygget til at rumme de mikrobiologiske
analyser, som omfatter dyrkning af bakterier og humane værtsceller.
Herfra bevæger vi os videre til det molekylærbiologiske laboratorium,
hvor vi ved hjælp af forskellige metoder arbejder med DNA-håndtering,
med kloning og med udvælgelse og kopiering af DNA-sekvenser. I det
proteinkemiske laboratorium oprenses og udvælges proteiner ud fra
forskellige kriterier. Disse proteiner undersøges via massespektrometri
i den sidste del af laboratoriet.
Til håndtering af de store mængder data, som kommer fra de forskellige
steder i laboratoriet,benytter vi et Laboratory Information Management
System (LIMS). Dette betyder, at vi elektronisk kan følge de forskellige
arbejdsgange og se resultater af de enkelte forsøg. På flere forskellige
stadier i arbejdet anvendes desuden forskellige bioinformatiske
værktøjer til udvælgelse af, hvilke gener vi skal arbejde med i
en bestemt organisme, til at designe nye forsøg og ikke mindst til
sammenligning af protein-protein-interaktioner.
Historie
ACE BioSciences A/S blev stiftet i marts 2001 af Angus King (forskningsdirektør),
Christian Hodal (finansdirektør) og Ejvind Mørtz (administrerende
direktør). Virksomhedens hovedinvestor er BankInvest, som er suppleret
af Dansk Innovationsinvestering og Vækstfonden. De tre stiftere
af virksomheden repræsenterer hver sit faglige område. Angus King
har i en længere årrække arbejdet med molekylærbiologi, proteininteraktioner
og proteinkomplekser. Ejvind Mørtz har de sidste 10 år specialiseret
sig indenfor proteomics med proteinanalyse via massespektrometri.
Christian Hodal har stor indsigt i og erfaring fra forskellige stillinger
på det finansielle marked. Siden stiftelsen er der blevet ansat
26 medarbejdere (forskere, laboranter, bioinformatikere og administrativt
personale). Et tal der er stadigt stigende.
Samarbejdspartnere
Allerede på nuværende tidspunkt har ACE BioSciences A/S etableret
samarbejder med flere forskellige højteknologiske virksomheder.
På grund af vores avancerede forskning og de store datamængder,
vi skal håndtere, har vi valgt at etablere et samarbejde med IBM
Life Science, som kan tilbyde en unik højteknologisk platform. Med
fokus på vores egen teknologiplatform samarbejder vi med Micromass
om at udvikle massespektrometri til protein-protein interaktioner
i sygdomsfremkaldende bakterier. Herudover samarbejder vi med forskellige
universiteter for at være på forkant med udviklingen i det akademiske
miljø og vi forhandler i øjeblikket med flere potentielle samarbejdspartnere
både blandt bioteknologiske og farmaceutiske virksomheder
|
